2016-17 sezonunu üçüncü bitiren Fenerbahçe, UEFA Avrupa Ligi'ne üçüncü ön elemeden başlayacak. UEFA Avrupa Ligi'nde üçüncü ön eleme turu kura çekimi 14 Temmuz'da gerçekleştirilecek. Temsilcimiz, bu turda maçlarını 27 Temmuz ve 3 Ağustos'da oynayacak. Sarı-lacivertliler, Avrupa Ligi 3. ön eleme turunda ve play-off'ta kuralara seribaşı olarak girecek.

İşte olası rakipler (Oleksandriya, Olimpik Donetsk, Oostende, D.Bükreş, U.Craiova, Arka Gdynia dışındakilerin tamamı birinci ve ikinci ön eleme turunu da oynayacak; geçerlerse rakip olabilecekler):
AIK Stockholm * (İsveç)
FC Oleksandriya, Olimpik Donetsk (Ukrayna)
FC Luzern ** (İsviçre)
Vojvodina Novi Sad *, Kızılyıldız * (Sırbistan)
Bröndby IF ** (Danimarka)
Videoton Fehervar * (Macaristan)
KV Oostende (Belçika)
AEL Limasol *, AEK Larnaca * (G.Kıbrıs)
Gabala FK **, Inter Bakü * (Azerbaycan)
Shakhtior Saligorsk * (Belarus)
Slovan Bratislava *, AS Trencin * (Slovak)
Skenderbeu Korçe * (Arnavutluk)
Aberdeen **, St.Johnstone * (İskoçya)
FC Utrecht ** (Hollanda)
SCR Altach *, Sturm Graz ** (Avusturya)
Dinamo Bükreş (Romanya)
Beitar Jerusalem * (İsrail)
FK Ventspils * (Letonya)
Odd Grenland * (Norveç)
Panionios ** (Yunanistan)
Universitatea Craiova (Romanya)
Arka Gdynia (Polonya)
NOT: * işaretli takımlar birinci ön eleme turunda, ** işaretli takımlar ikinci ön eleme turunda oynayacaklar.